公司员工的行为并不当然代表公司行为，但在特定条件下，员工的行为可被视为公司行为，并由公司承担相应的法律责任。具体来说，我们可以从以下几个方面进行分析：
一、员工行为代表公司行为的条件
根据《民法典》的相关规定，执行法人工作任务的人员，就其职权范围内的事项，以法人名义实施的民事法律行为，对法人发生效力。这意味着，如果员工是在其职权范围内，以公司的名义进行的行为，那么该行为通常会被视为公司行为。例如，公司的销售人员在销售产品过程中与客户签订的合同，或者公司的财务人员在处理公司财务事务时的行为，都可能被视为公司行为。
二、员工行为不代表公司行为的情形
超出职权范围：如果员工的行为超出了其职权范围，且没有得到公司的明确授权或追认，那么该行为通常不会被视为公司行为。例如，公司的普通员工未经授权擅自以公司名义签订合同，该合同对公司可能不产生法律效力。
非以公司名义：即使员工在其职权范围内行事，但如果其行为并非以公司名义进行，而是以个人名义或其他非公司名义进行，那么该行为也不会被视为公司行为。例如，员工以个人名义进行的私人交易，即使与公司业务有关，也不应由公司承担责任。
三、公司应对员工行为的法律责任
公司认可员工行为：如果公司认可员工在其职权范围内以公司名义进行的行为，那么公司应当承担相应的法律责任。这包括合同责任、侵权责任等。
公司不认可员工行为：如果公司不认可员工的行为，或者员工的行为超出了其职权范围且未得到公司授权，那么公司可能不需要承担法律责任。但是，如果公司存在管理过失，如未对员工进行充分的培训或监督，导致员工行为给第三方造成损失，公司可能仍需承担一定的法律责任。
四、实际案例分析
以您之前提到的案例为例，甲公司的会计在对账函上盖甲公司财务章对欠付货款金额进行确认，这属于会计在其职权范围内以公司名义实施的法律行为。因此，原则上该行为对甲公司发生法律效力。甲公司不能以盖章行为属于会计个人行为来否认该行为对公司的效力。但是，如果甲公司能够证明该对账函存在重大误解（如未提及货物质量问题导致的损失），则可能通过反诉等方式来排除或减轻其法律责任。
五、建议与风险提示
明确职权范围：公司应当明确员工的职权范围，并确保员工在其职权范围内行事。这有助于减少因员工行为超出职权范围而给公司带来的法律风险。
加强培训与监督：公司应当加强对员工的培训和监督，确保员工了解其行为可能带来的法律后果，并遵守公司的规章制度和法律法规。
及时处理纠纷：如果公司发现员工的行为可能给公司带来法律风险或纠纷，应当及时采取措施进行处理，如与第三方协商、寻求法律援助等。
如果您在公司法务方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。