针对您提出的“公司股东是法人单位的受益人备案怎么填”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，受益所有人信息备案主要针对的是那些需要备案的主体，如外国公司分支机构等，而并非所有公司都需要进行此项备案。不过，若您的公司属于需要备案的主体范畴，且股东为法人单位，那么您需要按照以下步骤进行受益人备案：

一、确定备案主体与标准

1. 备案主体：确认您的公司是否属于需要备案的主体，如外国公司分支机构等。若属于，则需进行受益所有人信息备案。

2. 备案标准：对于法人单位作为股东的情况，若该法人单位通过直接或间接方式最终拥有备案主体25%以上股权、股份或合伙权益，或者虽未满足此标准但最终享有备案主体25%以上收益权、表决权，或者单独或联合对备案主体进行实际控制，则该法人单位应被视为受益所有人进行备案。若不存在上述情形，则应将备案主体中负责日常经营管理的人员视为受益所有人进行备案。

二、备案时间

• 新设立的备案主体：自2024年11月1日起，在市场监管部门办理设立登记时，应同时通过相关登记注册系统备案受益所有人信息。若无法通过系统办理，则需在设立登记之日起30日内完成备案。

• 存量备案主体：在2024年11月1日以前登记注册的公司，应于2025年11月1日前完成受益所有人信息补充备案。

• 信息变更的备案主体：若受益所有人信息发生变化，或不再符合承诺免报条件，应在发生变化或不符合条件之日起30日内完成备案。

三、信息填报流程

1. 进入填报系统：在办理设立登记业务时，系统会根据企业类型自动判断是否需要填写受益所有人信息备案。若需要，则在填写到“其他成员”信息页面时，点击“受益人添加”进行填报。

2. 选择填报方式：

   • 自行填报：选择“自行填报”后，进入填报页面，选择受益所有权关系类型（如股权、收益权、实际控制等），并填写受益所有人和所有权限信息。可以填写一种或多种受益所有权关系类型，且同一类型中可填报一名或多名自然人信息（若法人单位作为受益所有人，则需填写该法人单位的相关信息，但实际操作中可能需进一步明确如何以法人单位身份填报，通常可能需要指定法人单位的代表或负责人作为具体填报对象）。
   • 承诺免报：若符合承诺免报条件，可选择此选项并填写承诺书。但需注意，若选择承诺免报而未实际填报，系统可能会提示未填报受益所有人信息。

3. 提交并确认：填报完成后，点击“下一步”并确认信息无误后，系统会弹出成功提示。

四、特殊注意事项

• 对于法人单位作为股东的情况，在填报时可能需要进一步明确如何以法人单位身份进行受益所有人信息的填报。通常，这可能需要指定法人单位的代表或负责人作为具体填报对象，并填写其相关信息。

• 若在填报过程中遇到问题或不确定如何填报，建议及时与当地市场监管局或中国人民银行分支机构联系以获取指导。

希望以上解答能够对您有所帮助。若您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告知。