合同中只有乙方有违约金条款是合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《民法典》的相关规定，合同是双方当事人意思表示一致的协议，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是合法有效的。在合同中，双方当事人可以自由约定违约责任，包括违约金的支付。因此，合同中仅约定乙方有违约金条款，而甲方没有，这并不违反法律的强制性规定，是合法的。
合同自由原则
合同自由原则是合同法的基本原则之一，它允许双方当事人在不违反法律的前提下，自由约定合同的内容。在违约金条款的设定上，双方当事人可以根据自身的利益和需求，协商确定违约金的支付方式和数额。如果双方当事人协商一致，仅在合同中约定乙方有违约金条款，那么这种约定就是有效的。
可能的法律后果
如果乙方违约：根据合同约定，乙方需要向甲方支付违约金。违约金的数额应当按照合同中的约定来确定，如果约定的违约金低于实际造成的损失，甲方可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；如果约定的违约金过分高于实际造成的损失，乙方可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。
如果甲方违约：由于合同中未约定甲方有违约金条款，因此甲方在违约时不需要向乙方支付违约金。但是，甲方仍然需要承担因违约给乙方造成的实际损失，包括直接损失和间接损失。乙方可以通过协商、调解、仲裁或者诉讼等方式，要求甲方赔偿损失。
律师建议
在签订合同时：双方当事人应当仔细阅读合同条款，特别是关于违约责任的部分。如果发现合同中仅约定了一方有违约金条款，而另一方没有，可以与对方协商修改合同，或者明确约定在另一方违约时的赔偿方式。
在履行合同过程中：如果一方当事人发现对方有违约行为，应当及时采取措施，防止损失扩大。同时，可以收集相关证据，以便在发生纠纷时能够证明对方的违约行为和自己的损失情况。
在发生纠纷时：双方当事人应当首先通过协商的方式解决纠纷。如果协商不成，可以考虑通过调解、仲裁或者诉讼等方式解决纠纷。在解决纠纷的过程中，应当遵循法律程序，尊重对方的合法权益。
总之，合同中只有乙方有违约金条款是合法的，但双方当事人在签订合同时应当谨慎考虑，明确约定违约责任，以避免发生纠纷。如果你在合同签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。