营业执照登记在他人名下，实际合伙人签署的合同在特定条件下是有效的。针对您提出的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 合同签署的有效性
- 名义与实际：在合伙经营中，如果营业执照登记在某人名下，但实际经营和出资由其他人进行，这并不影响合同的有效性。关键在于合同是否真实反映了双方的意思表示，并且符合法律法规的规定。
- 授权与追认：如果营业执照上的登记人授权实际经营人签署合同，或者事后对合同进行了追认，那么该合同同样具有法律效力。
二. 合伙协议的签订方式
- 登记人签订：可以让登记注册的人签订合伙协议，并在协议中明确出资、利润分配、增资等事宜。随后，登记注册的人可以签订授权委托书，授权实际经营人进行经营。- 例如，A是营业执照上的登记人，B是实际经营人。A可以与B签订合伙协议，并授权B进行日常经营。
- 实际经营人签订：两个实际经营人也可以直接签订合伙协议，在协议中明确说明是分别以他人的名义进行工商登记，但实际出资人、合伙人、合伙事项执行人为协议双方。- 例如，C和D分别是两个实际经营人，他们可以以自己的名义签订合伙协议，并在协议中注明是借用E和F的名义进行的工商登记。
三. 法律依据
- 根据《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，合伙协议是合伙企业设立和运营的基础，只要协议内容真实、合法，且符合合伙企业的利益，就应当认定其有效性。该法并未明确规定营业执照登记人与实际经营人必须一致，因此，在实际情况中，应更侧重于合同的实际履行和双方的真实意思表示。
我建议：在实际操作中，为了确保合同的合法性和有效性，双方最好在签订合同时明确各自的权利和义务，并尽可能获得营业执照登记人的授权或追认。同时，也可以考虑咨询专业律师，对合同进行进一步的审核和修改，以确保其符合法律法规的要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。