关于行政机关已发现违法行为的追诉时效，以下是我的详细解答：

1. 追诉时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。这是行政处罚追诉时效的一般规定。
   • 若违法行为涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果，则追诉时效延长至五年。但这一规定并不排除法律另有特别规定的情况。

2. “发现”的含义与判断标准：

   • “发现”指的是行政机关发现违法行为线索，而非实际查明违法行为人。原则上，以行政机关是否已经立案为标准来判断是否“发现”；或者虽然没有正式立案，但已经对违法行为进行了初步的调查取证，也属于对违法行为的发现。

3. 追诉时效的计算：

   • 追诉时效从违法行为发生之日起计算。若违法行为有连续或继续状态，则从行为终了之日起计算。
   • 例如，某商家持续销售不合格产品达3个月，追诉时效从其停止销售之日起算二年（若不涉及公民生命健康安全、金融安全且无危害后果）；若涉及，则追诉时效为五年。

4. 立案后的特殊情况：

   • 若行政机关已立案，则不受上述追诉时效限制。即使立案后较长时间才作出处罚决定，只要案件调查处理符合法定程序和要求，处罚依然有效。

5. 群众举报与追诉时效：

   • 根据全国人大常委会法工委的相关意见，群众举报后被认定属实的，发现时效以举报时间为准。

6. 五年追诉时效的适用情形：

   • 五年追诉时效的适用情形是“涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的”。如果行政违法行为未造成危害后果的，不适用五年的追责时效规定，仍然只能适用两年的追责时效。

7. 刑事责任与行政责任竞合时的处理：

   • 当产生刑事责任与行政责任的竞合时，应遵循“刑事优先”的原则。即，在一切调查处理程序中，发现有犯罪事实存在时，应当首先由有权管辖该案件的侦查或者司法机关依照刑事诉讼程序进行追究。
   • 刑事司法机关向行政机关移送的案件，即使违法行为已经超过了两年（或五年，视情况而定），也不能视为违法行为超过了法定追责时效。

综上所述，行政机关在追究违法行为时，需严格遵守追诉时效的规定，并根据违法行为的性质、后果及发现时间等因素综合判断。如有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。