核心前提：用户因配合公安机关调查导致车辆违停，询问如何处理。
结论与说明：
一般情况下，因配合公安机关调查导致的违停，通常不会被处罚：
- 在紧急情况下，如配合公安机关的调查、执行紧急任务等，车辆可能会临时停放在不允许停车的地方。这种情况下，如果驾驶员能够提供相关证明（如公安机关出具的证明、调查记录等），说明违停是由于配合调查所致，那么交通管理部门通常不会对其进行处罚。
若已收到违停罚单，可申请行政复议或提起行政诉讼：
- 如果用户已经收到了违停罚单，但认为该罚单是由于配合公安机关调查而导致的，可以向交通管理部门提出行政复议申请，说明情况并提供相关证明。如果行政复议结果不满意，还可以依法向人民法院提起行政诉讼，要求撤销或变更该罚单。
建议保留相关证据，以备不时之需：
- 为了避免后续可能出现的纠纷或误解，建议用户在配合公安机关调查时，尽量保留相关证据，如调查记录、公安机关出具的证明等。这些证据在后续处理违停问题时，将起到重要的证明作用。
总结：因配合公安机关调查导致的违停，通常不会被处罚。若已收到罚单，可申请行政复议或提起行政诉讼，并保留好相关证据。如有其他法律问题，可直接向我咨询。