针对您提出的问题，即“原告法人以自己名义签订租赁协议，原告用自己公司起诉，法院怎么认定主体合格案例”，以下是我的详细解答：

1. 主体资格的认定原则：

   • 在法律诉讼中，原告的主体资格是诉讼能否成立的基础。对于法人而言，其主体资格的认定主要依据其是否依法成立、是否具有独立的民事权利能力和民事行为能力。
   • 当法人以自己的名义签订租赁协议时，这通常意味着法人是以自己的身份参与民事活动，而非代表其股东或其他关联方。因此，在后续的诉讼中，法人作为原告起诉，其主体资格通常是合格的，只要它能够证明自己与案件有直接的利害关系。

2. 公司起诉的合法性分析：

   • 在您描述的情况下，原告法人（即公司）用自己公司的名义起诉，这是完全合法的。因为公司作为独立的民事主体，有权就其自身的权益提起诉讼。
   • 法院在认定原告主体资格时，会审查原告是否提供了有效的营业执照、法定代表人身份证明等文件，以证明其作为法人的合法性和独立性。同时，法院还会审查原告与案件之间的利害关系，确保原告有起诉的正当性和必要性。

3. 案例分析：

   • 在实际案例中，如果原告法人能够提供充分的证据证明其与租赁协议的签订和履行有直接的利害关系，并且该协议确实存在争议或违约情况，那么法院通常会认定原告的主体资格是合格的。
   • 例如，某公司以自己的名义与承租人签订了租赁协议，后因承租人违约而提起诉讼。在诉讼过程中，公司提供了租赁协议、付款凭证、违约通知等证据，证明了其作为原告的合法性和正当性。法院在审查这些证据后，认定了公司的主体资格，并依法进行了审理。

4. 建议与注意事项：

   • 对于法人而言，在签订合同和提起诉讼时，应确保自己的主体资格合法、有效，并保留好相关证据以备不时之需。
   • 如果在诉讼过程中遇到主体资格方面的争议或疑问，应及时向法院提供充分的证据和说明，以证明自己的合法性和正当性。

综上所述，法院在认定原告法人以自己名义签订租赁协议并起诉的主体资格时，会依据其是否依法成立、是否具有独立的民事权利能力和民事行为能力以及是否与案件有直接的利害关系等因素进行综合判断。如果您在类似情况下遇到法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。