您好，关于孤儿办理残疾证时邻居能否代理监护人的问题，这需要根据具体情况和相关法律法规来判断。

首先，根据一般的办理流程，申请残疾人证时，如果申请人是智力、精神残疾人或未成年人，通常需要由法定监护人代为申办。法定监护人应当尊重被监护人的真实意愿，并提供居民身份证和证明材料来证明双方的关系。这些证明材料可以是居民户口簿、公安机关出具的说明双方关系的证明材料，或者其他能够证明双方关系的合法证件如结婚证、出生证明等。

然而，在孤儿且没有法定监护人的情况下，邻居或其他个人是否可以作为代理监护人，这并不是一个简单的“是”或“否”的问题。它涉及到对监护制度的深入理解和应用。

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无民事行为能力或者限制民事行为能力的成年人，其监护人应当按照一定的顺序来担任，首先是配偶、父母、子女，然后是其他近亲属。如果这些人都无法担任监护人，那么其他愿意担任监护人的个人或者组织，在经过被监护人住所地的居民委员会、村民委员会或者民政部门同意后，也可以成为监护人。

在您提到的这种情况下，如果孤儿没有法定监护人，且邻居或其他个人愿意担任监护人，那么他们需要向被监护人住所地的居民委员会、村民委员会或者民政部门提出申请，并经过这些部门的同意。一旦获得同意，他们就可以作为代理监护人来帮助孤儿办理残疾证等相关事宜。

至于哪个部门出证明，这通常取决于具体的申请流程和当地的规定。一般来说，居民委员会、村民委员会或者民政部门在同意某人担任监护人后，可能会出具相关的证明文件来确认这一事实。这些证明文件在办理残疾证等后续事宜时可能会被要求提供。

综上所述，邻居或其他个人在特定条件下是可以作为代理监护人来帮助孤儿办理残疾证的，但需要经过相关部门的同意，并可能需要提供相应的证明文件。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。