核心前提：书记员配偶在本院提起诉讼，这可能涉及到利益冲突、回避制度以及司法公正等问题。

结论前置：

1. 应遵循回避制度：如果书记员或其配偶的诉讼案件与书记员的工作有直接关联，或者可能影响司法公正，那么书记员应当遵循回避制度，不参与该案件的审理或相关工作。

2. 确保司法公正：法院应确保所有案件的审理都遵循司法公正原则，不受任何外部因素干扰，包括书记员与其配偶的关系。

详细分析：

1. 关于回避制度：

   • 在司法实践中，为了确保案件的公正审理，避免利益冲突，通常会制定回避制度。如果书记员或其直系亲属（如配偶）与案件有直接利害关系，或者可能影响案件的公正审理，那么书记员应当主动申请回避，或者由法院决定其回避。
   • 回避制度是司法公正的重要保障，它有助于消除人们对司法公正性的疑虑，增强司法公信力。

2. 关于司法公正：

   • 司法公正是司法活动的核心价值，也是社会对司法的基本要求。在书记员配偶在本院提起诉讼的情况下，法院应更加严格地审查案件，确保所有程序都符合法律规定，不受任何外部因素干扰。
   • 法院可以通过加强内部监督、完善审判流程、提高法官素质等方式，来确保司法公正的实现。

3. 实际操作建议：

   • 如果书记员发现其配偶在本院提起诉讼，且该案件与其工作有直接关联，应立即向法院报告，并申请回避。
   • 法院在收到回避申请后，应及时进行审查，并作出是否回避的决定。如果决定回避，应另行安排其他人员参与案件的审理或相关工作。
   • 同时，法院也应加强对书记员等司法工作人员的教育和管理，提高他们的法律意识和职业道德水平，防止类似情况的发生。

总结：书记员配偶在本院提起诉讼时，应遵循回避制度，确保司法公正。法院也应加强内部监督和管理，提高司法活动的透明度和公信力。如果您有关于此类问题的进一步疑问或需要法律咨询，请随时向我提问。