针对您提出的问题“总公司控股股东有权让分公司负责人办注销吗”，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
首先，总公司确实有权注销分公司。这是因为分公司不具备独立法人资格，其民事责任最终由总公司承担。总公司作为分公司的母公司，在经营、管理等方面均对分公司拥有控制和支配权，因此有权根据自身经营战略和实际情况决定分公司的存续或注销。
然而，注销分公司并非总公司控股股东个人可以随意决定的事项，而是需要总公司通过合法程序（如股东会决议）来作出决定。这一决定应明确注销的原因、时间等相关事项，并确保符合公司章程和《公司法》的规定。
在决定注销分公司后，总公司需要遵循一系列法律程序和流程，包括但不限于：
内部决策：通过合法程序作出注销分公司的决定。
成立清算组：负责清理分公司的资产、债权债务等，并编制清算报告。
通知债权人并公告：确保债权人的合法权益得到保护。
税务注销：到税务部门办理税务注销手续，结清应纳税款等。
工商注销登记：携带相关文件到工商行政管理部门办理分公司的工商注销登记手续。
其他相关手续：如注销银行账户、社保账户等。
关于您提到的“总公司控股股东有权让分公司负责人办注销”这一具体问题，实际上，注销分公司的决定权在总公司层面，而非控股股东个人。控股股东虽然在公司中拥有较大的影响力，但注销分公司这样的重大决策仍需通过总公司的合法程序来作出。分公司负责人作为执行层，其职责是执行总公司的决策，而非自行决定注销分公司。
因此，总公司控股股东不能直接让分公司负责人办注销，而是需要通过总公司的合法程序来作出注销决定，并由分公司负责人按照这一决定来执行相关的注销流程。
在整个注销过程中，程序必须合法合规，以避免潜在的法律隐患。如果未依法清算就注销分公司，而分公司又存在债务纠纷等问题，总公司依旧要承担相应责任。所以，总公司注销分公司一定要严格遵循法律规定和流程。