自行车车位机动车长期停放是违法的。详细分析如下：

一、违法性判断

1. 专用车道规定：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十七条，道路划设专用车道的，在专用车道内，只准许规定的车辆通行，其他车辆不得进入专用车道内行驶。自行车车位是专为自行车设置的，机动车长期停放显然违反了这一规定。
2. 机动车停放规定：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第五十六条，机动车应当在规定地点停放。禁止在人行道上停放机动车（依法施划的停车泊位除外），且不得妨碍其他车辆和行人通行。机动车长期占用自行车车位，妨碍了自行车的正常停放和通行，因此也是违法的。

二、处罚措施

• 城市道路：若在城市道路旁的自行车车位长期停放机动车，交警可认定为违规停放，并可能处以20元至200元的罚款（常见为200元），甚至可能拖车处理，相关费用由车主承担。
• 小区内部：若在小区内自行车车位长期停放机动车，物业有权制止并要求移走。拒不配合者，物业可根据小区规定进行批评教育或处以违约金。

三、建议与指导

• 我建议机动车车主应严格遵守交通规则和停车规定，将车辆停放在指定的机动车停车位内，以避免不必要的法律纠纷和处罚。
• 对于长期占用自行车车位的机动车，相关部门和物业应加强管理和监督，及时制止和处罚违规行为。

综上所述，自行车车位机动车长期停放是违法的，不仅可能面临法律处罚，还可能给他人带来不便和安全隐患。因此，请务必遵守相关规定，文明停车。如有进一步需要，您可以继续咨询我。