当被害人不同意犯罪嫌疑人取保候审时，首先需要明确的是，取保候审的决定并不完全取决于被害人的意见，而是主要依据法律规定由司法机关作出。
取保候审的基本规定： 取保候审是《中华人民共和国刑事诉讼法》规定的一种刑事强制措施，旨在防止犯罪嫌疑人、被告人逃避侦查、起诉和审判。它要求犯罪嫌疑人、被告人提出保证人或者交纳保证金，并出具保证书，保证随传随到，从而对其不予羁押或暂时解除其羁押。这一措施的执行由公安机关负责。
被害人意见的作用： 虽然被害人可以向办案机关反映不同意对方取保候审的意见并说明理由，但这并非决定因素。司法机关在决定是否对犯罪嫌疑人、被告人取保候审时，会综合考量犯罪嫌疑人、被告人的社会危险性、所涉犯罪的性质和情节、可能判处的刑罚等多方面因素。
取保候审的适用条件： 根据《刑事诉讼法》第六十五条的规定，人民法院、人民检察院和公安机关对有下列情形之一的犯罪嫌疑人、被告人，可以取保候审：
被害人的后续权益维护： 若犯罪嫌疑人、被告人符合取保候审条件，即便被害人不同意，司法机关仍可能决定对其取保候审。然而，这并不意味着被害人的权益无法得到保障。在案件后续处理中，被害人可以通过提起附带民事诉讼等方式要求赔偿，以维护自身合法权益。
综上所述，当被害人不同意犯罪嫌疑人取保候审时，应向办案机关反映意见并说明理由，但最终决定仍由司法机关根据法律规定作出。同时，被害人也有权在案件后续处理中维护自身权益。