针对您提出的“在同一公司三年两次九级工伤怎么赔付”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、赔付原则与流程
在同一公司发生两次工伤，赔付标准将针对每一起特定的工伤事故分别进行评定与支付处理。每次工伤都需要依法进行工伤认定和劳动能力鉴定，以确定具体的伤残等级。赔付过程会全面充分地衡量这两次工伤事件对劳动者劳动能力所产生的实际影响及其严重性。
二、具体赔付项目与标准
医疗费：
- 每次工伤的医疗费都凭票据实报销，需符合工伤保险诊疗项目目录等相关规定。
停工留薪期工资福利待遇：
- 职工因工伤需要暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经确认可适当延长，但延长不得超过12个月。
一次性伤残补助金：
- 九级伤残的一次性伤残补助金标准为9个月的本人工资。本人工资是指工伤职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月平均月缴费工资。
- 在您的情况下，由于两次工伤均为九级，且发生在同一公司，通常可能会晋升一级伤残等级（具体需根据当地规定和劳动能力鉴定委员会的确定），按八级伤残标准享受相应工伤保险待遇，即一次性伤残补助金为11个月的本人工资（但此为可能情况，实际仍需以当地规定和鉴定结果为准）。不过，若不晋升伤残等级，则每次工伤均独立核算，按九级伤残标准赔付一次性伤残补助金。
一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金：
- 若两次工伤最终构成伤残等级，在解除或终止劳动关系时，这两项补助金一般按最高伤残等级计发，但部分地区可能会有特殊规定，比如将两次工伤等级合并考虑来确定赔偿标准。
- 在您的情况下，若两次工伤均认定为九级，且不晋升伤残等级，则具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，各地金额存在差异。若晋升为八级伤残，则按八级伤残标准计发这两项补助金。
三、特殊情况与注意事项
伤残等级晋升：
- 两次工伤均为九级时，是否晋升伤残等级需根据当地规定和劳动能力鉴定委员会的确定。部分地区可能会考虑晋升一级伤残等级，以更合理地反映劳动者的实际劳动能力损失。
赔偿计算：
- 具体赔偿数额需结合职工本人工资、治疗花费、停工留薪期时长等实际情况综合计算。因此，在申请赔付时，需提供充分的证据和资料以支持赔偿请求。
法律适用：
- 同一单位两次工伤赔偿并无特殊单独法律规定，但在实际处理中有相应规则。需遵循《工伤保险条例》等相关法律法规的规定进行赔付。
四、建议与行动
及时申请工伤认定和劳动能力鉴定：
- 在发生工伤后，应及时向所在单位报告，并申请工伤认定和劳动能力鉴定。这是获得赔付的前提和基础。
了解当地政策和规定：
- 不同地区的工伤保险政策和规定可能存在差异。因此，在申请赔付前，需了解当地的具体政策和规定以确保赔付的顺利进行。
咨询专业律师或机构：
- 若对赔付过程或结果存在疑问或不满，可咨询专业律师或机构以获取更详细的法律建议和帮助。
综上所述，在同一公司三年两次九级工伤的赔付问题需根据当地规定、劳动能力鉴定结果以及具体赔付项目与标准进行综合确定。希望以上解答能对您有所帮助。