公司注销后，员工在一定条件下仍可以申请仲裁。具体分析如下：
公司合法清算并注销：
- 若公司经过合法清算程序，并且已经依法支付了员工的相关费用（如工资、经济补偿金等），员工的权益在清算过程中已得到妥善处理，那么员工通常不能再申请仲裁。
- 在这种情况下，公司作为法人主体的资格已经消灭，债权债务关系也已清理完毕，因此不再具有诉讼主体资格。
公司未经合法清算或恶意逃避债务：
- 若公司未经合法清算就注销，或者存在恶意逃避债务的行为（如拖欠工资、未支付经济补偿金等），这就损害了员工的合法权益。
- 在这种情况下，员工可以将清算组成员、股东等作为被申请人申请仲裁，以维护自身的合法权益。
- 根据相关法律，如果清算组成员因故意或重大过失造成损失，或者股东未足额出资等，都可能需要对公司债务承担连带清偿责任。
申请仲裁时需要注意的事项：
- 员工在申请仲裁时，需要提交相关的证明材料，如劳动争议仲裁申诉登记表、申诉书、身份证明材料、与被诉人存在劳动关系的证明材料等。
- 如果公司还在破产清算阶段，企业法人的地位仍然存在，那么员工在申请仲裁时仍然可以将企业法人列为被申请人。
- 如果公司已经注销，员工需要抓紧时间申请仲裁，并在立案后到工商局备案，以减缓公司注销的流程和速度，确保自己的权益得到保障。
综上所述，公司注销后员工是否能申请仲裁取决于公司的注销情况和员工的权益是否得到妥善处理。如果员工的权益受到损害，他们可以通过申请仲裁来维护自己的合法权益。