关于您提出的“融资租赁两年前扣的车两年后要起诉还融资租赁公司垫付款是否行得通”的问题，我进行了详细的分析，以下是我的解答：
结论前置：
在融资租赁合同中，若承租人未按时支付租金，出租人（融资租赁公司）有权依据合同条款采取相应措施，包括扣车。然而，两年后起诉要求承租人支付垫付款的可行性，取决于多个因素，如合同条款、扣车后的处理流程、以及是否存在时效问题等。
详细分析：
合同条款的约定：
- 首先，需要审查融资租赁合同中关于租金支付、违约责任、垫付款项及追偿权等条款的约定。若合同中明确规定了出租人在承租人违约时有权扣车，并保留了追偿垫付款的权利，那么出租人两年后起诉要求支付垫付款在合同层面上是可行的。
扣车后的处理流程：
- 扣车后，出租人通常应按照合同约定的程序处理车辆，如评估价值、变卖或拍卖等，以抵偿承租人的欠款。若出租人未按照约定程序处理，或处理过程中存在不当行为，可能会影响其后续追偿垫付款的合法性。
时效问题：
- 根据相关法律规定，民事诉讼的时效期间一般为三年。因此，若出租人在扣车后两年内未提起诉讼或采取其他有效措施追偿垫付款，可能会面临时效问题。在此情况下，出租人需要证明存在时效中断或中止的情形，否则其诉讼请求可能会因超过时效而被驳回。
其他考虑因素：
- 除了上述因素外，还需要考虑承租人是否存在其他违约行为、出租人是否已尽到合理通知义务、以及车辆的实际价值是否足以抵偿欠款等因素。这些因素都可能影响出租人追偿垫付款的可行性和成功率。
建议：
- 在决定起诉前，出租人应仔细审查融资租赁合同条款，确保自身权利得到有效保障。
- 若存在时效问题或其他法律障碍，出租人应及时咨询专业律师，寻求合适的解决方案。
- 出租人在扣车后应严格按照合同约定的程序处理车辆，避免不当行为导致后续追偿困难。
综上所述，融资租赁两年后起诉要求承租人支付垫付款的可行性取决于多个因素。在决定起诉前，出租人应充分考虑各种因素，并咨询专业律师以获取准确的法律意见。