当摩托车撞了你的车，且责任在对方时，赔偿问题涉及多个方面。以下是对此问题的详细解答：
结论前置
摩托车撞了你的车，若责任在对方，赔偿将依据事故责任认定、赔偿项目与标准、赔偿流程进行。具体赔偿金额需根据实际损失计算，并先由对方交强险在限额内赔付，超出部分按比例分担。
一、立即报警与责任认定
- 立即报警：事故发生后，应立即拨打122报警电话，确保事故得到及时处理。
- 责任认定：交警部门会到现场进行勘查，并根据双方当事人的行为对事故发生的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任。若对方负主要责任，一般按约70%的比例来承担赔偿责任。
二、赔偿项目与标准
赔偿项目主要包括以下几类：
- 医疗费：包括诊疗费、医药费、住院费等因治疗伤者而产生的费用。需凭医疗收费票据主张，注意保留相关证据。
- 车辆维修费：你的车辆因事故受损，需要维修的费用。应提供维修清单和费用发票。
- 其他财产损失：如车辆上的物品损坏等，也需根据实际情况进行赔偿。
- 交通费：因处理事故或车辆维修而产生的交通费用，需提供正式票据。
- 其他合理费用：根据实际情况确定，如因事故导致的误工费等。
具体的赔偿金额需依据实际的损失情况仔细计算。
三、赔偿流程
- 协商赔偿：在交警部门的协调下，双方当事人可以尝试协商解决赔偿问题。如果达成一致，可以签订赔偿协议并履行。
- 保险公司理赔：若对方摩托车投保了交强险和商业三者险，应及时联系保险公司报案并配合理赔流程。保险公司将根据保险合同约定承担相应的赔偿责任。先由对方的交强险在其责任限额内进行赔付，超出的部分再按照责任比例来分担。
- 调解处理：如果协商不成，可以申请交警部门进行调解。交警部门会根据事故情况和相关法律法规提出调解方案，促使双方达成和解。
- 诉讼解决：如果调解仍然无法解决争议，你可以向人民法院提起民事诉讼，要求对方承担相应的赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明自己的损失和对方的过错。
四、注意事项
- 保留证据：务必妥善保管好所有与事故相关的证据材料，包括但不限于现场照片、视频录像、医疗记录、费用单据、维修清单等。这些证据将在后续的赔偿协商或法律程序中起到关键作用。
- 及时报案：事故发生后，应尽快向交警部门和保险公司报案，以便及时处理和理赔。
- 了解保险情况：了解对方的保险情况，以便在赔偿过程中更好地维护自己的权益。
总之，当摩托车撞了你的车且责任在对方时，应依法进行赔偿。你可以根据上述流程和注意事项来处理此事，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。