协议合同是可以进行公证的。公证是公证机构依据自然人、法人或者其他组织的申请，严格按照法定程序，对民事法律行为、具备法律意义的事实以及文书的真实性、合法性进行证明的一项重要活动。对协议合同进行公证，能够显著增强其法律效力和证明力，这样在未来可能出现的法律纠纷中，经过公证的协议合同会更具公信力。

具体来说，如果想给协议合同进行公证，申请人需要准备好协议合同以及其他相关材料，然后前往公证机构。公证员会对协议合同的内容、形式等各个方面进行细致审查，只有确认其合法有效后，才会予以公证并出具公证书。

需要注意的是，公证并非协议合同生效的必要条件。只要协议合同本身是符合法律规定的，即便没有经过公证，它同样具有法律效力。不过，公证能够为协议合同提供额外的保障和证明，就像给协议合同穿上了一层“防护甲”，能有效减少潜在的法律风险，让合同的履行更加顺利和安心。

总的来说，如果对协议合同的效力比较看重，或者希望在未来可能出现的法律纠纷中有更强的证据支持，那么考虑对协议合同进行公证是一个不错的选择。