驾驶营运车辆在高速公路上违法停车，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及相关法律法规，扣分情况具体如下：
驾驶营运客车在高速公路行车道上停车：一次记9分。这是因为高速公路行车道是车辆正常行驶的车道，停车会严重影响其他车辆通行，极易引发交通事故，存在重大安全隐患。
驾驶营运客车在高速公路应急车道非紧急情况下停车：一次记6分。应急车道是供处理应急事务的车辆使用的，非紧急情况下停车占用应急资源，影响应急车辆通行。但请注意，若因车内乘客突发疾病等紧急情况需在应急车道临时停车，应立即开启危险报警闪光灯，在来车方向150米以外设置警告标志，并迅速报警，此情况通常不被认定为违规。
综上所述，驾驶营运车辆在高速公路上违法停车的扣分情况根据具体停车位置和情况有所不同，驾驶人应严格遵守交通安全法规，避免在高速公路上随意停车，以确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。