在部队遭受不公平对待可以起诉。但需要注意的是，起诉的具体方式和程序可能因具体情况而有所不同。以下是对此问题的详细分析：

一. 起诉的法律依据

根据《中华人民共和国行政诉讼法》第二十五条，起诉的原告必须是与行政行为有利害关系的公民、法人或者其他组织。这意味着，如果你在部队遭受了不公平对待，且这种对待可以视为行政行为的一部分，那么你有权提起行政诉讼。

二. 起诉的具体条件

1. 原告资格：你必须是与部队的具体行政行为有利害关系的公民。
2. 明确的被告：你需要明确指出被起诉的部队单位或其成员。
3. 具体的诉讼请求和事实根据：你需要明确说明起诉的原因、目的以及所依据的事实和理由。
4. 受案范围和管辖：确保案件属于人民法院的受案范围，并确定正确的受诉人民法院。如果涉及军事机密或军事犯罪等问题，可能需要由军事法院进行管辖和审理。

三. 起诉的程序

1. 准备起诉状和相关证据材料：起诉状应记明原告和被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由、证据和证据来源等。
2. 提交起诉状：向有管辖权的人民法院或军事法院递交起诉状和相关证据材料。
3. 等待法院受理：法院将对起诉进行审查，决定是否受理。如果受理，将进行立案并通知原告缴纳诉讼费用。
4. 参与诉讼程序：一旦案件被法院受理，你需要积极参与后续的诉讼程序，包括出庭应诉、提供证据、进行辩论等。

四. 注意事项

• 由于部队具有一定的特殊性，涉及到军事机密等问题，因此在起诉过程中可能需要遵守一些特殊的法律规定和程序要求。
• 在起诉前，建议充分收集证据并咨询专业律师以获取更详细的法律指导和帮助。

我的观点是，如果你在部队遭受了不公平对待，且这种对待可以视为行政行为的一部分，那么你有权依法提起行政诉讼。但请务必遵循法律程序并准备好必要的材料和证据。如有进一步需要，您可以继续咨询我。