违反其他协议的代持协议，其有效性需根据具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：
代持协议的性质：
- 代持协议，本质上是双方就股权、房屋、资产等权益的代持事宜达成的合意，属于合同的一种。
- 合同的效力，原则上遵循《中华人民共和国民法典》的相关规定，即合同应当具备行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定，以及不违背公序良俗等要件。
违反其他协议对代持协议效力的影响：
- 若代持协议本身的内容并未违反法律或行政法规的强制性规定，且双方意思表示真实，那么即使它违反了双方之前签订的其他协议，也不必然导致代持协议无效。
- 但若代持协议的内容或目的违反了法律或行政法规的强制性规定，如涉及金融监管禁止的代持行为、逃避债务、洗钱等非法目的，那么该代持协议将被认定为无效。
特殊领域的代持协议效力：
- 在某些特殊领域，如金融领域，监管机关对代持行为有严格的限制。例如，商业银行、信托、基金、证券、保险等金融类公司的股权代持协议，若违反了相关金融监管规定，将被认定为无效。
- 对于上市公司的股权代持，根据新公司法及相关司法政策，上市公司的股权代持协议通常也被认定为无效，以维护资本市场的秩序。
代持协议的法律后果：
- 若代持协议被认定为有效，则双方应按照协议的约定履行各自的义务，享受相应的权利。
- 若代持协议被认定为无效，则双方应基于无效合同的法律后果进行处理，如返还财产、赔偿损失等。
综上所述，违反其他协议的代持协议并不必然无效，其有效性需根据代持协议本身的内容、目的以及是否违反法律或行政法规的强制性规定来判断。若您在具体案件中遇到此类问题，建议详细咨询专业律师以获取准确的法律意见。