全体村民不能因合同纠纷阻止施工。针对村委会拍卖林地20年后施工单位施工，全体村民对合同有纠纷的情况，以下是从法律角度的详细分析：

一. 施工依据合法合同进行，阻止施工可能违约或侵权

• 施工行为通常是依据合法有效的建设工程合同进行的。如果村民仅仅因为对合同存在纠纷就阻止施工，可能会违反合同约定，甚至构成侵权。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

二. 涉及工程安全等重大问题时，应通过合法途径解决

• 如果村民认为施工存在明显安全隐患，可能威胁到人身和财产安全，他们有权向相关部门反映并要求暂停施工以消除隐患。这是合法的维权方式，基于保障公众人身财产安全的原则。例如，如果村民发现施工使用的建筑材料不符合安全标准，或者施工操作不规范，他们可以向建设工程安全监督管理部门报告。

三. 恶意阻止施工需承担法律责任

• 如果村民恶意阻止施工，并因此给对方造成损失，他们可能需要承担相应的法律责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如果阻止施工的行为构成破坏生产经营罪，还可能面临刑事处罚。此外，即使不构成犯罪，也可能需要根据《中华人民共和国治安管理处罚法》接受治安处罚。

四. 建议通过合法途径解决合同纠纷

• 面对合同纠纷，我建议村民首先尝试与村委会或施工单位进行协商，寻求和解。如果协商不成，可以请求有关机构进行调解，或者根据施工合同中的仲裁条款申请仲裁。如果合同中没有仲裁条款或者仲裁不成，村民还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径解决纠纷。

综上所述，全体村民不能因合同纠纷而阻止施工。他们应该通过协商、调解、仲裁或诉讼等合法途径解决纠纷，并在必要时向相关部门反映施工中的安全问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。