针对您提出的“检察建议异议应该如何回复”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、理解检察建议的性质

检察建议是检察机关在履行法律监督职责过程中，针对有关单位在管理、制度等方面存在的问题或漏洞，提出改进建议的法律文书。它具有法律效力和监督性质，因此，收到检察建议的单位应当认真对待，及时研究并回复。

二、回复检察建议的基本原则

1. 及时性：收到检察建议后，应在规定的时间内（通常为1个月）进行回复，如有特殊情况需延期，应提前与检察机关沟通并说明理由。

2. 针对性：回复内容应逐一对应检察建议书中提出的问题，避免笼统表述，确保每个问题都得到明确的回应。

3. 真实性：回复内容应真实准确，反映实际情况，不得虚假整改或隐瞒事实。

4. 规范性：回复应按照正式公文格式撰写，使用规范的语言和表述方式，避免口语化或模糊表述。

三、回复检察建议的具体步骤

1. 签收确认：收到检察建议书后，及时签收并登记，确认文书送达情况。

2. 组织研究：由相关部门或负责人牵头，对检察建议内容进行逐项分析，明确问题性质、整改责任主体及时间节点。

3. 制定整改方案：针对检察建议书中指出的问题，制定具体的整改措施，包括修订制度、加强培训、开展专项整治等，并明确完成时限。

4. 撰写回复函：

   • 标题：关于对[检察建议书文号]的回复。
   • 主送单位：明确写明回复对象（如“XX人民检察院”）。
   • 正文：
     • 引言：简要说明已收到检察建议书，表明重视态度。
     • 整改落实情况：逐条回应检察建议书提出的问题，说明具体整改措施及成效。如有未完全整改的情况，应客观说明原因、当前进展及后续计划。
     • 下一步工作计划：巩固整改成果，防止问题反弹，提出未来的工作计划和措施。
   • 落款单位及日期：加盖公章并注明回复时间。

5. 审核审批：回复函撰写完成后，应经分管领导或主要领导审核通过后，加盖公章正式发出。

6. 跟进落实：定期向检察机关反馈整改进展，必要时提交阶段性报告，确保整改措施得到有效落实。

四、处理异议的情况

如果您对检察建议书中的某些内容存在异议，可以在回复中明确提出，并附上相关证据或理由进行说明。同时，建议与检察机关进行积极沟通，以便更好地理解对方的立场和意图，并寻求双方都能接受的解决方案。

五、示例模板

以下是一个回复检察建议书的示例模板：

关于对[XX检察院][202X]X号检察建议书的回复

XX人民检察院：

我单位于202X年X月X日收到贵院《检察建议书》（[202X]X号），针对建议书指出的问题，我单位高度重视，并进行了认真研究。现就相关问题及整改情况回复如下：

## 一、问题认领及整改情况


1. 关于[问题A]的整改：
   - 我单位已修订[相关制度]，新增条款X项，明确责任分工；
   - 组织全员培训X次，覆盖XXX人次，提升员工对[问题A]的认识和处理能力；
   - 已完成[具体整改措施]，并取得[具体成效]。

2. 关于[问题B]的异议及说明：
   - 我单位认为[问题B]的表述存在歧义，实际情况为[具体说明]；
   - 针对该问题，我单位已采取[具体措施]进行改进，并取得[具体成效]；
   - 为进一步澄清事实，我单位附上[相关证据或材料]供贵院参考。

## 二、下一步工作计划


1. 巩固现有整改成果，定期开展自查自纠，确保问题不反弹；
2. 加强与贵院的沟通协作，共同推动相关问题的解决和改进；
3. [其他具体工作计划]。

特此回复。

附件：1. [整改方案]
    2. [培训记录]
    3. [相关证据或材料]

XX单位（盖章）
202X年X月X日

通过以上步骤和示例模板，您可以清晰、详细、有深度地回复检察建议书，并有效处理可能存在的异议情况。