公路工程临时用地费用通常由承包人（施工单位）承担。以下是对此结论的详细解释：

1. 临时用地原则：

   • 根据相关规定，临时用地应遵循“谁使用谁负责办理手续及恢复和移交工作”的原则。这意味着施工单位作为临时用地使用方，需负责办理相关法律手续，并负责恢复已使用的耕地和林地以及办理移交工作。

2. 费用承担：

   • 临时用地的所有费用，包括临时用地青苗补偿费、土地损失费、复垦保证金及国土、林地审批的相关规费等，均由承包人支付。这是施工单位使用临时用地所必须承担的经济责任。

3. 法律依据：

   • 相关管理办法明确规定，施工单位需与县市（区）协调指挥部正式签订使用临时用地的协议，并按照协议的要求支付使用临时用地的费用。这提供了法律上的依据，确保了施工单位承担临时用地费用的合法性。

4. 实际操作：

   • 在实际操作中，施工单位在申请临时用地得到相关部门批准后，会与相关部门签订协议，并依据协议支付费用。同时，施工单位也需负责临时用地的复垦工作，并在完成复垦后经过验收合格才能退还复垦保证金。

综上所述，公路工程临时用地费用由承包人（施工单位）承担，这是基于相关规定和实际操作中的普遍做法。如有任何疑问或需要进一步了解相关细节，请直接向我咨询。