政府集中采购不可以委托代理公司。根据《政府采购法》的相关规定，我来详细解释一下：
法律规定：
- 《政府采购法》第十八条第一款明确规定：采购人采购纳入集中采购目录的政府采购项目，必须委托集中采购机构代理采购。这意味着，对于纳入集中采购目录的项目，采购人必须委托集中采购机构，而不能委托社会代理机构。
不同情形的处理：
- 如果采购项目完全属于集中采购目录内，那么必须委托集中采购机构，不能有任何例外。
- 如果采购项目部分属于集中采购目录，部分不属于，那么对于属于目录内的部分，仍然必须委托集中采购机构；对于不属于目录内的部分，采购人可以自行采购，也可以委托集中采购机构或社会代理机构在委托的范围内代理采购。但需要注意的是，集采目录内的项目不能委托社会代理机构。
特殊情况的说明：
- 对于科研院所采购科研设备等特殊情况，虽然可以不委托集中采购机构采购，但通过分散采购来实现，这并不改变集中采购目录内项目必须委托集中采购机构的基本规定。
综上所述，政府集中采购必须委托集中采购机构代理采购，而不能委托社会代理机构。这是由《政府采购法》明确规定的，也是政府采购制度的基本要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。