客运恶意降价违反的是《道路旅客运输及客运站管理规定》。具体来说：

结论：客运经营者恶意降价，违反了《道路旅客运输及客运站管理规定》中关于运价的规定，属于不正当竞争行为，将可能面临相应的法律责任。

分析说明：

1. 法规依据：根据《道路旅客运输及客运站管理规定》，客运经营者应当遵守有关运价规定，不得乱涨价、恶意压价、乱收费。这一规定明确了客运经营者在运价方面的行为准则，恶意降价显然违反了这一准则。
2. 法律责任：对于恶意降价的客运经营者，交通运输主管部门将依法予以处罚，责令其退还乘客相关费用，并督促其加强问题整改，确保运营合法、服务规范。这表明，恶意降价行为不仅损害了市场公平竞争秩序，也损害了乘客的合法权益，因此必须承担相应的法律责任。
3. 实际案例：在实际操作中，如果有乘客发现客运经营者存在恶意降价行为，可以向交通运输主管部门举报，相关部门将及时调查核实，并根据实际情况对违规经营者进行处罚。

综上所述，客运恶意降价违反了《道路旅客运输及客运站管理规定》，属于不正当竞争行为，将可能面临法律责任。因此，客运经营者应当严格遵守运价规定，确保运营合法、服务规范，以维护市场公平竞争秩序和乘客的合法权益。如果你还有其他关于交通运输方面的法律问题，可以直接向我咨询。