不动产继承公证收费一般不需要排除非继承部分。下面我将从相关法律规定和实际操作角度进行详细解释：

法律解释

不动产继承公证的收费通常是根据继承的财产价值来确定的，而不是仅仅基于继承部分的价值。在公证过程中，公证机构会对整个不动产的价值进行评估，并据此收取相应的公证费用。因此，非继承部分的价值通常也会被纳入考虑范围。

实际操作

在实际操作中，公证机构在办理不动产继承公证时，会要求提供不动产的权属证明、继承人的身份证明以及相关的遗产分配协议等文件。这些文件会作为公证的依据，用于确定不动产的价值以及继承人的继承份额。公证机构在收取费用时，会根据不动产的整体价值以及当地的公证收费标准来计算公证费用，而不会单独排除非继承部分的价值。

特殊情况说明

当然，也存在一些特殊情况，比如非继承部分的价值极低或者与继承部分完全独立，且公证机构在评估时能够明确区分开来。在这种情况下，公证机构可能会考虑对非继承部分进行单独处理，但这并不是普遍的做法，具体还需要根据当地的公证规定和实际情况来确定。

综上所述，不动产继承公证收费一般不需要排除非继承部分。如果你在具体办理过程中遇到了相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的解答和建议。