关于代为偿还抵押贷款的借款合同效力问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、法律法规依据
《物权法》第一百九十一条第二款：
- 规定抵押期间，抵押人未经抵押权人同意，不得转让抵押财产，但受让人代为清偿债务消灭抵押权的除外。
《担保法解释》第六十七条：
- 规定抵押权存续期间，抵押人转让抵押物未通知抵押权人或者未告知受让人的，如果抵押物已经登记的，抵押权人仍可以行使抵押权；取得抵押物使用权的受让人，可以代替债务人清偿其全部债务，使抵押权消灭。
《物权法》第十五条：
- 确立不动产物权变动的原因与结果相区分的原则，即当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，自合同成立时生效；未办理物权登记的，不影响合同效力。
二、效力分析
合同效力与物权变动区分：
- 根据《物权法》第十五条，物权转让行为不能成就，并不必然导致物权转让合同无效。即使抵押物转让未经抵押权人同意，但受让人代为清偿债务消灭抵押权的，转让合同仍然有效。
受让人涤除权：
- 受让人可以通过行使涤除权，即代替债务人清偿全部债务，来消灭抵押权。一旦受让人清偿债务，抵押权即消灭，转让行为也随之有效。
立法目的与利益平衡：
- 相关法律法规旨在实现抵押权人、抵押人和受让人之间的利益平衡。既充分保障抵押权不受侵害，又不过分妨碍财产的自由流转，充分发挥物的效益。
三、实际案例
- 重庆索特盐化股份有限公司与重庆新万基房地产开发有限公司土地使用权转让合同纠纷案：
- 在此案例中，最高人民法院终审认为，即使转让抵押物未经抵押权人同意，但受让人通过行使涤除权涤除转让标的物上的抵押权负担的，转让行为有效。这体现了法律法规在抵押权人和抵押人、受让抵押标的物的第三人之间实现利益平衡的立法精神。
四、结论
综上所述，代为偿还抵押贷款的借款合同，在受让人代为清偿债务消灭抵押权的情况下，该借款合同是有效的。这一结论既符合相关法律法规的规定，也体现了立法目的和利益平衡的原则。因此，在实际操作中，如遇到类似情况，可以参照上述法律法规和案例进行处理。