在公司停业整顿期间，如果发现有拉超载车的情况，处理方式应当严谨且符合法律法规。以下是对此问题的详细解答：

首先，要明确的是，无论是公司正常运营期间还是停业整顿期间，拉超载车都是违反交通法规的行为，对道路交通安全构成严重威胁。因此，一旦发现此类行为，必须立即采取相应措施。

针对公司停业整顿期间拉超载车的处理，可以从以下几个方面进行：

1. 立即制止并报告：

   • 一旦发现超载车辆，应立即制止其继续行驶，并确保车辆停放在安全地点。
   • 及时向相关执法部门（如交通运输管理部门、交警部门）报告，以便他们进行进一步处理。

2. 配合执法部门调查：

   • 公司应积极配合执法部门的调查工作，提供必要的文件、资料和信息。
   • 如实陈述事实，不得隐瞒或歪曲真相。

3. 接受处罚并整改：

   • 根据执法部门的调查结果，公司应接受相应的行政处罚，如罚款、停业整顿延长等。
   • 针对超载问题，公司应进行深入反思，制定并落实有效的整改措施，确保类似问题不再发生。

4. 加强内部管理和培训：

   • 停业整顿期间，公司应加强对驾驶员和车辆的管理，确保所有车辆都符合交通法规的要求。
   • 组织驾驶员进行安全教育和培训，提高他们的安全意识和法律意识。

5. 恢复运营前的审查：

   • 在停业整顿期满并准备恢复运营前，公司应向相关执法部门提交整改报告，并接受审查。
   • 只有当执法部门确认公司已经整改完毕并符合运营条件时，才能恢复运营。

综上所述，公司停业整顿期间拉超载车的处理需要严格遵循法律法规，积极配合执法部门的工作，并采取有效的整改措施以确保道路交通安全。同时，公司也应加强内部管理和培训，提高员工的安全意识和法律意识，避免类似问题的再次发生。