当您因跑黑车（即未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的行为）被运管抓住后，需要按照以下流程来缴纳罚款：

一、接受处罚决定

首先，运管部门会依法对您的车辆进行暂扣，并进行详细的调查取证工作。在查明事实后，运管部门会根据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，对您作出处罚决定。这包括责令停止经营、没收违法所得以及罚款等。

二、了解罚款金额和缴纳方式

1. 罚款金额：

   • 如果您有违法所得，且违法所得超过2万元，那么罚款将是违法所得的2倍以上10倍以下。
   • 如果您没有违法所得或违法所得不足2万元，那么罚款将是3万元以上10万元以下。

2. 缴纳方式：通常情况下，运管部门会在处罚决定书中明确告知您罚款的缴纳方式，这通常包括到指定银行缴纳罚款。请务必按照处罚决定书上的要求，在规定期限内完成罚款的缴纳。

三、缴纳罚款

1. 到指定银行缴纳：请携带处罚决定书和您的身份证件，到运管部门指定的银行网点进行罚款缴纳。银行工作人员会根据处罚决定书上的信息，为您办理缴纳手续。

2. 获取缴纳凭证：在缴纳罚款后，请务必保留好银行提供的缴纳凭证。这是您已经履行处罚决定的证明，也是后续取回被暂扣车辆的依据。

四、后续处理

1. 取回被暂扣车辆：在履行完处罚决定并缴纳罚款后，您可以凭借缴纳凭证和相关身份证明，到运管部门办理取回被暂扣车辆的手续。但请注意，您可能需要支付停车费用。

2. 遵守法律法规：请务必吸取教训，严格遵守道路运输法规，不再从事非法运营活动。否则，您将可能面临更严重的法律后果。

综上所述，当您因跑黑车被运管抓住后，需要按照上述流程接受处罚、缴纳罚款，并办理后续手续。如有任何疑问或需要帮助，请及时咨询专业律师或法律机构以获取有效帮助。