在判决时，公安在侦办过程中查封的房产不能直接赔偿给被害人。下面我将详细解释这一结论：

首先，我们要明确公安在侦办过程中查封房产的性质。查封是公安机关在刑事侦查过程中，为了防止犯罪嫌疑人转移、隐匿财产，确保后续诉讼活动的顺利进行，而采取的一种强制性措施。被查封的房产，其所有权并未发生转移，仍然属于犯罪嫌疑人或相关权利人。

其次，关于赔偿被害人的问题。在刑事案件中，被害人因犯罪行为遭受的损失，应当通过刑事附带民事诉讼或者单独的民事诉讼途径来寻求赔偿。法院在判决时，会根据犯罪嫌疑人的犯罪情节、被害人的损失情况等因素，依法作出赔偿判决。但这一赔偿判决并不直接涉及被查封房产的处置。

最后，被查封房产的处置方式。被查封的房产，在案件审结后，会根据判决结果和法律规定进行处置。如果犯罪嫌疑人被判定有罪，且房产与犯罪活动有关，那么房产可能会被依法没收或者拍卖，所得款项用于赔偿被害人或者上缴国库。但如果房产与犯罪活动无关，或者犯罪嫌疑人被判定无罪，那么房产应当被解除查封，归还给原权利人。

综上所述，公安在侦办过程中查封的房产，在判决时不能直接赔偿给被害人。被害人应当通过合法的诉讼途径来寻求赔偿，而被查封房产的处置则应当根据判决结果和法律规定来进行。如果你在这方面有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。