国有土地和村集体建设用地在搬迁的时候，主要存在以下几个方面的区别：

1. 土地性质不同：

   • 国有土地归国家所有。
   • 村集体建设用地则归农村集体组织成员集体所有。

2. 拆迁主体不同：

   • 国有土地拆迁一般由市、县级人民政府负责。
   • 村集体建设用地拆迁的主体通常是农村集体经济组织或相关政府部门。

3. 补偿依据不同：

   • 国有土地房屋拆迁主要依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》，按市场评估价进行补偿。
   • 村集体建设用地房屋拆迁则一般参考《土地管理法》等相关规定，补偿相对复杂，包含土地补偿费、安置补助费等多项费用。

4. 拆迁程序不同：

   • 国有土地拆迁有严格的征收程序，如公告、评估、补偿协议签订等。
   • 村集体建设用地拆迁除履行相关程序外，还涉及土地权属变更等手续。

5. 安置方式不同：

   • 国有土地拆迁多为货币补偿或房屋产权调换。
   • 村集体建设用地拆迁除货币补偿和产权调换外，可能还会安排宅基地重新建房等安置方式。

综上所述，国有土地和村集体建设用地在搬迁时，由于土地性质、拆迁主体、补偿依据、拆迁程序以及安置方式等方面的不同，会导致具体的搬迁操作和补偿安置方式有所差异。如果您在具体搬迁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。