当事人可以不同意案件合并审理。合并审理并非必然要征得当事人的同意，但在某些情况下，需要经过当事人同意，具体分析如下：
无需当事人同意的情形：在民事诉讼中，当出现符合法定情形时，如多个诉讼标的是基于同一法律关系，法院拥有依职权决定合并审理的权力，无需当事人点头认可。这样做能够提高司法效率，避免对同一法律关系进行重复审理，让司法资源得到更合理的配置。
需要当事人同意的情形：如果合并审理有可能对当事人的合法权益造成损害，比如增加诉讼成本、导致审理期限延长进而影响当事人权利的及时行使等，通常就需要经过当事人的同意。
当事人不同意时的处理：当当事人表示不同意合并审理时，法院需要对其提出的理由进行认真审查。如果当事人提出的理由并不成立，比如只是出于拖延诉讼等不合理目的，法院依然可以决定合并审理，以维护司法秩序和公正。但如果当事人提出的理由合理，比如合并审理会使其面临巨大的经济压力或者严重影响其权利的及时实现，法院就应当尊重当事人的意愿，分别进行审理。
综上所述，是否需要当事人同意合并审理，要结合具体案件的实际情况以及相关法律规定来综合判断。如果你面临这样的情况，可以将具体案情告诉我，我会为你提供更详细的法律分析和建议。