破产管理人由人民法院指定。以下是详细分析：
一. 破产管理人的指定主体
- 人民法院的指定权：根据《中华人民共和国企业破产法》第二十二条，破产管理人是由法院受理破产申请时，为了加强对债务人财产的管理，保护全体债权人的共同利益，由法院指定的担负债务人财产的管理、清理、处分、变价、分配等职责的机构或个人。这表明，破产管理人的指定主体是人民法院。
- 债权人的更换申请权：虽然破产管理人由人民法院指定，但债权人会议如认为管理人不能依法、公正执行职务或者有其他不能胜任职务情形的，可以申请人民法院予以更换。这体现了债权人在破产程序中的一定参与权和监督权。
二. 破产管理人的选任过程
- 管理人名册制度：目前，我国实行的是管理人名册制度，中、高级人民法院通过编制管理人名册确定本地的管理人队伍。人民法院在指定破产管理人时，会从管理人名册中选定，并综合考虑破产案件的性质、规模、复杂程度等因素。
- 选任的考虑因素：人民法院在指定破产管理人时，会综合考虑多种因素，如管理人的专业资质、经验、信誉等，以确保管理人能够胜任破产管理工作，公正、高效地处理破产事务。
三. 特殊情况下的管理人指定
- 债权人推荐：在部分地方，如上海、杭州、北京等地，根据当地的相关规定或实践，债权人可以向人民法院推荐管理人。但这并不意味着债权人可以直接指定管理人，推荐的管理人仍需经过人民法院的审查和指定。
- 特定案件的指定：对于一些特殊类型的破产案件，如金融机构破产等，可能会根据相关法律法规的规定，指定特定的机构或人员担任管理人。
综上所述，破产管理人由人民法院指定，这是法律规定的明确内容。虽然债权人在部分情况下可以推荐管理人，但最终的指定权仍掌握在人民法院手中。如有进一步需要，您可以继续咨询我。