当商家拒绝赔偿1000元时，你可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：
首先，明确结论：你可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等合法途径来要求商家赔偿。
接下来，是具体的操作步骤：
收集证据：
- 整理所有与赔偿事项相关的证据，如购买凭证（发票、订单截图）、产品质量问题的照片或视频、与商家的沟通记录（聊天记录、通话录音）等。
与商家协商：
- 在证据充分的基础上，再次尝试与商家进行友好协商，明确表达你的赔偿要求，并了解商家拒绝赔偿的具体原因。
寻求第三方介入调解：
- 若协商无果，可以向交易平台投诉（如果交易发生在电商平台上），或者拨打12315向所在地的消费者协会提出投诉，请求他们出面进行调解。
- 还可以选择向工商管理局、市场监督管理局等有关行政部门投诉，这些部门会对商家的行为进行监管和查处。
法律手段维权：
- 如果调解仍然无法解决问题，你可以考虑委托律师起草并向商家发送律师函，或者直接提请仲裁（如果与商家之间有仲裁协议）或向有管辖权的法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，你需要提交充分的证据来证明自己的权益受到了损害。如果胜诉而商家仍不履行赔偿义务，你可以向法院申请强制执行。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买、使用商品或者接受服务时，其合法权益受到损害的，有权依法要求赔偿。商家不得故意拖延或无理拒绝消费者的赔偿要求，否则将承担相应的法律责任。
其他辅助手段：
- 在某些情况下，你还可以选择向公众媒体揭露事件，以引发社会各界的广泛关注和舆论压力，从而促使商家尽快解决问题。但请谨慎使用此手段，避免侵犯他人合法权益或造成不良影响。
综上所述，当商家拒绝赔偿时，你应保持冷静、理性维权，并通过多种合法途径来维护自己的合法权益。在处理过程中，请始终保留好相关证据，以便在需要时提供证明。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。