信用卡逾期50000通常指的是本金，但还款时可能需先还利息和费用。

详细分析如下：

1. 逾期本金的含义：

   • 信用卡逾期50000，这通常指的是逾期未还的本金金额。本金是持卡人透支消费但未按期偿还的金额。

2. 还款冲抵顺序：

   • 当信用卡逾期后，持卡人还款时，并非直接冲抵本金。根据发卡机构与持卡人的合同约定，以及相关法律法规，还款通常首先冲抵逾期利息、违约金（滞纳金）等费用，然后再冲抵本金。
   • 例如，若逾期产生了一定利息和违约金，这些费用会优先从还款中扣除，剩余部分才会用于冲抵本金。

3. 逾期利息和违约金的计算：

   • 逾期利息是基于逾期本金、逾期天数和逾期利率计算的。信用卡逾期利息日息率通常为万分之五（0.0005）。
   • 违约金则根据发卡银行在信用卡领用合约中的约定，通常不得超过实际损失的30%，信用卡逾期的滞纳金通常为最低还款额未还清部分的5%。

4. 逾期还款的后果：

   • 逾期不还将在个人征信记录上留下不良记录，影响贷款申请、信用卡申请及出国等事宜。
   • 逾期90天以上，银行有权向法院起诉持卡人。若持卡人以非法占有为目的，超限额或超期透支，并经两次催收后超过3个月仍不归还，将被认定为恶意透支，构成信用卡诈骗罪。

因此，信用卡逾期50000指的是本金，但在还款时，需根据合同约定和法律法规，先偿还逾期利息、违约金等费用，再冲抵本金。建议持卡人尽量避免逾期还款，以免产生不必要的费用和信用记录污点。如已逾期，应尽快与银行沟通，了解还款细节，并按约定或法定顺序进行清偿。