处理医护人员欠款的问题，首先需要明确欠款的性质和来源。如果欠款是指医护人员个人因私事而产生的债务，那么这应当属于个人财务问题，需要个人自行解决，或者通过法律途径如债务协商、重组或破产等方式来处理。

然而，如果欠款是指基层医疗卫生机构因业务运营（如业务用房建设维修、医疗设备购置等）而形成的债务，并且涉及到医护人员的薪资或福利未能按时支付，那么这就需要依据相关政策文件来指导和解决。

根据国务院办公厅转发的《关于清理化解基层医疗卫生机构债务的意见》，对于这类债务，应遵循“制止新债、锁定旧债、明确责任、分类处理、逐步化解”的总体要求。具体处理步骤如下：

1. 摸清底数，锁定债务：

   • 由地方政府组织审计、财政、卫生、监察等部门对每个基层医疗卫生机构的债务进行清理核实，确保债务数据的真实性、完整性和准确性。

2. 明确化债主体，分类化解债务：

   • 根据举债主体、债务来源和债务用途对债务进行分类，并明确县乡政府、卫生行政部门和基层医疗卫生机构的责任。
   • 将审核认定的债务从基层医疗卫生机构剥离出来，交给当地政府负责化解。

3. 落实政府投入责任，坚决制止发生新债：

   • 各级政府要严格按照相关政策要求，落实对基层医疗卫生机构的基本建设、设备购置、经常性收支差额补助等各项经费，确保不留经费缺口。
   • 未经批准的项目不得实施，已批准的项目不得随意扩大规模或提高标准，以防止产生新的债务。

4. 加强组织领导，制定实施方案：

   • 各地区和有关部门要加强组织领导，明确责任分工，制定具体的实施方案，并报上级部门备案。
   • 定期跟踪和评估债务化解的进展情况，及时解决出现的问题。

5. 严格执行财经纪律，建立责任追究制度：

   • 各地要严格遵守财经纪律，不得借新债还旧债，不得向群众摊派，不得挤占挪用其他医改专项资金。
   • 对违反规定搞建设、上项目、借新债的基层医疗卫生机构和部门，要依法依规追究相关责任人的责任。

此外，从更广泛的角度来看，解决医疗机构欠款问题还需要完善医疗机构的财务管理和资金监管机制，确保医疗机构的资金能够合理使用和及时回笼。同时，也可以借鉴广东省医保局的做法，通过建立健全全省统一的药品和医用耗材货款直接结算机制，提升医药货款支付效率，降低医药企业流通成本，从而间接减轻医疗机构的财务压力。

综上所述，处理医护人员欠款的问题需要根据欠款的性质和来源采取不同的措施。对于基层医疗卫生机构因业务运营而形成的债务，应依据相关政策文件进行分类处理、逐步化解，并确保政府投入责任的落实和财经纪律的严格执行。