物权区分原则在特定情况下可以适用于违法建筑。以下是对这一结论的详细阐述：
首先，我们需要明确什么是违法建筑。根据城乡规划法的相关规定，违法建筑是指未取得建设工程规划许可证件，或者违反建设工程规划许可证件规定，进行建设所建造的建筑物、构筑物和其他附着物。这些建筑可能因程序或实质上的违规而被认定为违法。
接下来，我们探讨物权区分原则是否适用于违法建筑。物权区分原则，即物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定进行登记或交付，以发生物权效力。对于违法建筑，虽然其建造行为可能违反了法律法规，但在某些情况下，建造人可能仍对违法建筑享有一定的占有权益。
占有保护：根据最高法专家的观点，违法建筑可以适用物权法占有制度予以保护。这意味着，即使建筑本身是违法的，但建造人在未被依法拆除或没收之前，仍享有对该建筑的占有权益。任何人不得随意侵犯这种占有权益，否则可能构成侵权行为。
区分处理：行政机关在处理违法建筑时，应区分实质违章和形式违章。对于可以通过程序补正成为合法建筑的，应给予改正的机会；对于无法改正的，则依法进行拆除或没收。这种区分处理的方式，也体现了物权区分原则的精神，即对不同情况的违法建筑采取不同的处理措施。
法律限制：虽然建造人在建造违法建筑时可能取得了一定的占有权益，但这种权益是受到法律限制的。一旦行政机关依法作出拆除或没收的决定，建造人就必须服从，并失去对违法建筑的占有权益。这是物权受到公法限制必然结果。
综上所述，物权区分原则在特定情况下可以适用于违法建筑。但需要注意的是，这种适用是有限制的，并且必须遵循法律法规的规定。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。