《“三无”船舶联合认定办法》主要是为了严厉查处和打击利用“三无”船舶进行的各类水上违法犯罪活动，如走私、非法运输、非法捕捞、非法采砂、偷渡等。该办法确实在维护我国水域正常管理秩序、准确认定船舶性质方面发挥了重要作用，并且其认定结果也可以作为依法处置相关船舶的依据。以下是对您问题的详细解答：

一、“三无”船舶的定义

“三无”船舶指的是那些无船名船号、无船舶证书、无船籍港等情形的各类机动、非机动船舶，以及其他按照船舶管理的水上移动或漂浮设施、装置。这里的“船舶证书”具体指的是船舶检验证书、船舶登记证书以及从事相关活动的船舶依法应当持有的其他证书证件。

二、联合认定的主体与程序

1. 主体：县级以上地方人民政府负责组织、协调本辖区内“三无”船舶的联合认定工作。
2. 程序：
   • 相关部门如需开展“三无”船舶联合认定，应向所在地县级以上地方人民政府提供相关材料，并做好船舶扣押、保管、勘验准备和相关保障工作。
   • 县级以上地方人民政府会成立联合认定小组，该小组由海事管理机构、渔业渔政管理机构、船舶检验机构等相关单位组成，必要时还可吸收公安、港航、海警、海关以及乡（镇）人民政府等有关单位参加。
   • 联合认定小组会对船舶进行资料审核、船舶勘验和数据比对，经过集体讨论后形成勘验报告，并出具联合认定意见。

三、认定标准与时限

1. 认定标准：具有《办法》第九条所列情形之一的，可以认定为“三无”船舶。这些情形包括但不限于船舶未依法取得相关证书、所有证书均已被注销或撤销、船舶系未经审批或建造检验擅自非法建造等。
2. 认定时限：联合认定小组应当自收到相关材料之日起30日内完成认定工作，并由地方人民政府将认定意见反馈相关单位。案情复杂、认定困难的，可以延长至45日。

四、认定意见的法律效力

联合认定小组依据《办法》出具的联合认定意见，可以作为依法处置相关船舶的依据。这意味着，一旦船舶被认定为“三无”船舶，相关部门就可以依据这一认定意见对船舶进行依法处置。

五、与刑事犯罪的关联

虽然《“三无”船舶联合认定办法》本身并不直接规定刑事犯罪的处理方式，但其认定结果对于打击利用“三无”船舶进行的刑事犯罪活动具有重要意义。在实际操作中，如果一艘船舶被认定为“三无”船舶，并且该船舶被用于实施走私、非法运输、非法捕捞等刑事犯罪活动，那么这一认定意见就可以作为追究犯罪嫌疑人刑事责任的重要依据之一。

综上所述，《“三无”船舶联合认定办法》在维护水域管理秩序、打击水上违法犯罪活动方面发挥了重要作用。其认定结果不仅具有法律效力，而且可以为相关部门依法处置“三无”船舶提供有力支持。