寻衅滋事罪由人民检察院负责起诉。以下是详细解释：

1. 寻衅滋事罪的起诉主体：

   • 寻衅滋事罪属于公诉范畴，由人民检察院代表国家提起公诉。
   • 在寻衅滋事案件中，公安机关首先进行立案侦查，搜集足够证据证实犯罪事实后，将案件移送至人民检察院。
   • 人民检察院会对案件进行细致审查，包括证据的真实性与充分性等，若认定构成犯罪且符合起诉条件，则以国家的名义向人民法院提起公诉，请求对犯罪嫌疑人作出定罪量刑的裁决。

2. 寻衅滋事罪与自诉案件的区别：

   • 自诉案件主要由受害人直接向人民法院提起诉讼，而寻衅滋事罪作为公诉案件，其起诉主体是人民检察院。
   • 自诉案件通常包括侮辱、诽谤、暴力干涉婚姻自由、虐待等特定类型的案件，而寻衅滋事罪不属于这些类型，因此由人民检察院提起公诉。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果寻衅滋事行为未构成犯罪，仅是一般的治安违法行为，则由公安机关予以处理，无需通过起诉来解决。受害人可向公安机关报案，公安机关依照《治安管理处罚法》的相关规定，对寻衅滋事者进行处罚，如实施行政拘留、罚款等措施。

综上所述，寻衅滋事罪由人民检察院负责起诉。如果受害人或相关当事人对寻衅滋事案件有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会提供专业的法律解答和建议。