针对“立案程序有问题判决怎么处理”这一问题，首先需明确的是，立案程序的问题可能会影响到整个诉讼过程的合法性和判决的有效性。以下是对此问题的详细分析：

1. 判决效力的判断：

   • 如果立案程序存在严重违法，如未依法送达起诉状、未依法组成合议庭、未依法公开审理等，这些程序违法可能导致判决被认定为无效。
   • 在某些情况下，即使立案程序存在轻微瑕疵，但如果这些瑕疵并未影响案件的实体公正，判决仍可能被认定为有效。

2. 处理方式：

   • 上诉或申诉：如果当事人认为立案程序存在问题，且这些问题影响了判决的公正性，可以在法定期限内向上级法院提起上诉或向原审法院提出申诉，请求撤销或改判。
   • 申请再审：在判决生效后，如果当事人发现新的证据或认为原审判决存在重大错误，包括立案程序上的错误，可以申请再审。
   • 请求检察监督：当事人还可以向检察机关申请监督，请求检察机关对立案程序及判决的合法性进行审查。

3. 证据收集与准备：

   • 当事人在提起上诉、申诉或再审请求时，应尽可能收集并提供相关证据，以证明立案程序存在的问题及其对判决公正性的影响。

4. 法律咨询与代理：

   • 面对复杂的法律问题，当事人可以寻求专业律师的帮助，律师可以提供详细的法律咨询，帮助当事人分析案情，制定合适的法律策略，并代理当事人进行上诉、申诉或再审等法律程序。

综上所述，立案程序有问题时，当事人应根据具体情况判断判决的效力，并通过上诉、申诉、再审或请求检察监督等方式进行处理。同时，建议当事人及时咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和帮助。