员工自动离职时，经济补偿金的计算是一个涉及多个因素的问题。以下是对此问题的详细解答：

一、自动离职经济补偿金的基本原则

通常情况下，员工自动离职意味着员工主动离开工作岗位，并未按照劳动合同或公司规定提前通知或办理离职手续。在这种情况下，用人单位一般无需支付经济补偿金。然而，如果用人单位存在法定过错，导致员工被迫自动离职，那么用人单位就需要按照法律规定支付经济补偿金。

二、法定过错情形

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位存在以下情形之一，且导致员工被迫自动离职的，需要支付经济补偿金：

1. 未按劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件；
2. 未及时足额支付劳动报酬；
3. 未依法为劳动者缴纳社会保险费；
4. 用人单位的规章制度违反法律、法规规定，损害劳动者权益；
5. 以欺诈、胁迫等手段或乘人之危，使劳动者在违背真实意思的情况下订立或变更劳动合同；
6. 因特定法定情形致使劳动合同无效；
7. 法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。

三、经济补偿金的计算标准

经济补偿金按员工在本单位工作的年限计算，具体标准如下：

1. 每满一年支付一个月工资的经济补偿金；
2. 六个月以上不满一年的，按一年计算，即支付一个月工资的经济补偿金；
3. 不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿金。

这里的“月工资”指的是员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。如果员工的月工资高于所在地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿金的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。

四、特殊情况下的经济补偿金

如果用人单位以暴力、威胁或非法限制人身自由等手段强迫员工劳动，或者违章指挥、强令冒险作业危及员工人身安全，员工可以立即解除劳动合同，无需事先告知用人单位，并且能够获得经济补偿金。这种情况下的经济补偿金计算标准与上述标准相同。

五、注意事项

1. 员工自动离职时，应确保自己的离职行为符合法律规定和公司规定，避免因不当离职而失去获得经济补偿金的资格。
2. 如果用人单位存在法定过错导致员工被迫自动离职，员工应及时收集相关证据，以便在申请经济补偿金时提供有力支持。
3. 经济补偿金的支付方式和时间应与用人单位进行协商确定，确保双方权益得到保障。

综上所述，员工自动离职时经济补偿金的计算是一个复杂的问题，需要根据具体情况进行判断和计算。如果员工认为自己的离职行为符合获得经济补偿金的条件，应及时与用人单位进行沟通并申请相关权益。