针对公司不在注册地且涉嫌偷税漏税的情况，处理起来需要遵循一定的法律程序和税务规定。以下是一些建议的步骤和措施：
一、初步核实与调查
信息核实：
- 税务机关首先会通过多种渠道（如税务登记信息、纳税申报记录、实地核查等）核实公司的实际经营情况，包括是否确实不在注册地经营，以及是否存在偷税漏税的行为。
立案调查：
- 如果发现公司确实存在偷税漏税的嫌疑，税务机关将按照法定程序进行立案调查。这包括向企业送达《税务检查通知书》，要求企业提供相关财务和税务资料。
二、税务处理与处罚
补税与滞纳金：
- 如果调查确认公司存在偷税漏税行为，税务机关将依法要求公司补缴税款，并加收滞纳金。滞纳金是根据逾期缴纳税款的天数和金额来计算的。
税务行政处罚：
- 对于偷税漏税行为，税务机关还将依法对公司进行行政处罚，包括罚款、停止出口退税等。具体处罚措施会根据偷税漏税的严重程度和相关法律法规来确定。
公告送达与权利保障：
- 如果公司已经无法直接联系或送达文书，税务机关可能会采取公告送达的方式。同时，公司享有陈述、申辩和听证的权利，可以在税务机关作出处罚决定前进行申辩或提出听证申请。
三、后续监管与防范
加强监管：
- 税务机关将加强对该公司的后续监管，确保其依法纳税，不再出现偷税漏税行为。这可能包括定期或不定期的税务检查、纳税评估等。
企业自律与合规：
- 公司应该加强内部财务管理和税务合规意识，确保依法纳税。可以聘请专业的税务顾问或会计师进行税务筹划和申报，避免再次出现税务问题。
法律救济途径：
- 如果公司对税务机关的处理决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
四、总结与建议
对于公司不在注册地且涉嫌偷税漏税的情况，税务机关将依法进行调查和处理。公司应该积极配合税务机关的调查工作，及时补缴税款并接受处罚。同时，加强内部财务管理和税务合规意识，确保未来依法纳税。如果面临税务争议或问题，可以寻求专业的法律救济途径来维护自己的权益。