在交通事故赔偿中，当双方被认定为主次责任时，赔偿的处理方式主要遵循以下步骤和原则：

一、赔偿处理步骤

1. 交强险互赔：首先，由双方的交强险在限额内互相赔偿。例如，如果一方车损3000元，另一方车损1000元，那么1000元的损失由对方交强险赔偿，剩余的2000元在本方交强险无责财产限额内赔偿（通常为100元），剩余的1900元则需要按责任比例分担。

2. 超出交强险部分按责任比例赔付：交强险赔偿后，超出部分按照双方的责任比例进行赔付。一般来说，主要责任方承担70%（或60%-90%，具体依实际情况而定），次要责任方承担30%（或10%-40%，具体依实际情况而定）。

3. 涉及人身伤亡的赔偿：如果事故涉及人身伤亡，同样先由交强险在限额内赔偿，超出部分也按责任比例分担，包括医疗费、伤残赔偿金等。

二、责任比例划分

• 机动车与机动车之间：主要责任方通常承担70%-80%的责任，次要责任方承担20%-30%的责任。
• 机动车与非机动车、行人之间：机动车主要责任时，可能承担80%-90%的责任；次要责任时，可能承担40%-60%的责任（但非机动车或行人次要责任时，其承担比例通常较低）。

三、具体赔偿计算

假设双方损失总计为10万元，交强险赔偿后剩余8万元，那么：

• 如果主要责任方承担70%，则需要赔偿8万 * 70% = 5.6万元；
• 次要责任方承担30%，则需要赔偿8万 * 30% = 2.4万元。

四、理赔流程

1. 确定损失：双方需各自统计因事故造成的人身伤亡及财产损失情况。
2. 计算赔偿：根据责任比例和损失情况计算各自应承担的赔偿金额。
3. 支付赔偿：赔偿方先向对方支付应承担的赔偿款。
4. 申请理赔：赔偿方随后向自身保险公司申请理赔，提供相关材料如事故认定书、损失清单等，经审核后获得保险赔付。

五、注意事项

• 在处理赔偿事宜时，双方应提供相关证据，如事故责任认定书、损失清单、医疗票据等。
• 如果协商不成，可以通过交警调解或诉讼等方式确定最终赔付金额。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您在交通事故赔偿方面还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。