针对您提出的“有集体使用证的宅基地变更农田怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，宅基地和农田在土地用途上是有所区别的。宅基地主要用于农村居民住宅建设，而农田则用于农业生产。因此，将宅基地变更为农田，涉及到土地用途的变更，需要遵循一定的法律程序和规定。

一、了解相关政策法规

在变更土地用途前，建议您先了解当地关于土地管理、宅基地使用、农田保护等方面的政策法规。这些政策法规可能因地区而异，因此您需要咨询当地土地管理部门或相关部门以获取准确的信息。

二、申请土地用途变更

1. 提交申请：您需要向当地土地管理部门提交土地用途变更的申请，并提供相关材料，如集体使用证、土地变更用途的说明等。

2. 审核审批：土地管理部门会对您的申请进行审核，包括土地用途变更的合理性、是否符合当地土地规划等。如果审核通过，您需要按照相关规定办理土地用途变更手续。

三、注意事项

1. 遵守法律法规：在办理土地用途变更过程中，您需要遵守相关法律法规，不得擅自改变土地用途或进行违法建设。

2. 保护农田资源：农田是宝贵的资源，需要得到保护。在变更土地用途时，应充分考虑农田的保护和利用，避免对农田造成破坏或浪费。

3. 咨询专业人士：如果您对土地用途变更的程序和规定不熟悉，建议咨询专业人士或当地土地管理部门的工作人员，以获取准确的指导和帮助。

综上所述，将宅基地变更为农田需要遵循一定的法律程序和规定。在办理过程中，您需要了解相关政策法规、提交申请并办理相关手续。同时，也需要注意遵守法律法规、保护农田资源和咨询专业人士等事项。希望这些解答能对您有所帮助。