驾驶证考了二科后闯红灯，应按照闯红灯的违法行为进行处理，与驾驶证考试进度无关。
详细分析：
一、闯红灯的认定与处罚
认定：闯红灯通常通过电子眼抓拍，当车辆在红灯亮起时已经完全通过了停止线，并在路口内被连续拍摄到三张照片（车辆驶过停止线、车辆驶到路口中间、车辆到达对面路口），则构成闯红灯。
处罚：
- 记分：依据《道路交通安全违法行为记分分值》，违反道路交通信号灯通行，一次记6分。
- 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，将处警告或者二十元以上二百元以下罚款，通常罚款金额为200元，但具体可能因地区而异。
二、处理流程
确认违法信息：闯红灯后，一般会在3-15天内收到交通违法通知。可通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如交管12123）或前往交警队、行政综合处理大厅查询违法详情。
接受处罚：
- 携带身份证、驾驶证（如有）、行驶证（如驾驶的是机动车），前往交警队或行政综合处理大厅接受处罚决定书，并在规定时间内缴纳罚款。
- 若当地支持线上处理，可通过交管12123 APP等渠道在线处理和缴纳罚款。
三、特殊情况说明
- 若因交警现场指挥导致闯红灯，可事发后向交警大队申请调流证明，以避免处罚。
- 闯红灯记录将留存在驾驶证信息系统中，可能影响车辆保险、年检等。
四、对驾驶证考试的影响
- 闯红灯的处罚与驾驶证考试进度无直接关联，不会直接影响正在进行的驾驶证考试。
- 但需注意的是，若因闯红灯导致驾驶证被记分或扣留，在驾驶证考取或实习期间可能会产生不利影响，如实习期延长、无法按时取得驾驶证等。
综上所述，驾驶证考了二科后闯红灯，应按照正常的交通违法处理流程进行，即确认违法信息、接受处罚，并密切关注驾驶证状态。同时，应以此为鉴，严格遵守交通规则，确保行车安全，避免再次发生类似违法行为。如有进一步需要，您可以继续咨询我。