母亲与新生婴儿做亲子鉴定的费用通常在2000元至5000元之间。具体费用因鉴定类型、样本类型、机构资质及是否加急服务等因素而异。以下是对这一问题的详细分析：

一. 鉴定类型对费用的影响

1. 个人隐私亲子鉴定：

   • 费用：约2000元至2800元（父子/母子二联体）。
   • 特点：匿名办理，无需证件，报告仅作个人参考，不具备法律效力。
   • 适用场景：母亲仅想私下确认与新生婴儿的亲子关系。

2. 司法亲子鉴定：

   • 费用：约2400元至3600元（二联体），每增加一名被鉴定人可能加收1000元至1600元。
   • 特点：需现场采样并验证身份，结果具备法律效力，适用于落户、继承等法律场景。
   • 适用场景：若母亲需要将亲子鉴定结果作为法律证据，如办理新生婴儿的出生证明、落户等。

二. 样本类型对费用的影响

• 常规样本（如血液、口腔拭子）费用较低。
• 特殊样本（如指甲、烟头等）处理复杂，可能加收200元至500元。
• 对于新生婴儿，常用的样本类型为口腔拭子或血液样本。

三. 机构资质对费用的影响

• 具备司法资质的实验室收费较高，但结果具备法律效力。
• 普通机构价格较低，但结果仅限个人参考。

四. 加急服务对费用的影响

• 如需加急出结果，可能额外收取500元至2000元的加急费用。
• 加急服务的具体费用视鉴定机构的服务水平和加急程度而定。

五. 地区差异对费用的影响

• 一线城市费用普遍高于二三线城市。例如，北京、上海的亲子鉴定费用可能比中小城市高10%至20%。

总结：

母亲与新生婴儿做亲子鉴定的费用因多种因素而异。如果您仅想私下确认亲子关系，可以选择个人隐私亲子鉴定，费用相对较低；如果您需要将鉴定结果作为法律证据，则应选择司法亲子鉴定。在选择鉴定机构时，建议优先考虑具备司法鉴定许可证及CNAS认证的机构，以确保结果的合法有效。同时，也应关注机构的服务质量和价格透明度，避免隐性收费。如有进一步需要，您可以继续咨询我。