农民工工资账户与公司账户相分离，能在一定程度上保障农民工工资的支付安全和及时性。以下是具体的分析：

1. 资金隔离，降低风险：

   • 农民工工资账户与公司其他账户相分离，意味着用于支付农民工工资的资金被单独管理，不会与公司其他经营资金混同。这样，即使公司面临经营困难或财务问题，也能在一定程度上确保农民工工资不受影响，降低工资被挪用或拖欠的风险。

2. 专款专用，保障支付：

   • 分离后的农民工工资账户，其资金主要用于支付农民工的工资。这种专款专用的方式，能够确保在工资支付时，资金充足且及时到位，避免因公司资金流转问题而延误工资支付。

3. 监管加强，提升透明度：

   • 农民工工资账户的设立和分离，通常受到相关政府部门的监管。这种监管不仅要求公司按时足额支付工资，还要求公司公开透明地管理该账户，从而进一步提升农民工工资支付的透明度和公信力。

4. 法律保障，维护权益：

   • 在法律层面，农民工工资账户与公司账户相分离也是保障农民工权益的一项重要措施。若公司违反规定，挪用或拖欠农民工工资，农民工可以依法向相关部门投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，农民工工资账户与公司账户相分离，是一种有效的制度设计，旨在保障农民工工资的支付安全和及时性。然而，也需要注意到，这一制度的有效实施还需要依赖政府部门的严格监管和公司的自觉遵守。如有任何关于农民工工资支付的问题或疑虑，建议及时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律帮助。