公司一般不能对员工进行直接罚款。罚款属于行政处罚的范畴，根据《行政处罚法》的规定，只能由行政机关或法律授权的组织行使。企业作为民事主体，并不具备行政执法资格，因此在公司的规章制度中设定罚款条款是无效的，即使这些制度是通过民主程序制定的，如员工手册等。

然而，如果员工因过错给公司造成了经济损失，公司可以依据《工资支付暂行规定》第十六条来处理。这条规定允许公司按照劳动合同的约定从员工的工资中扣除赔偿金，但扣除的上限为月工资的20%，且扣除后的余额不得低于当地最低工资标准。这实际上是一种经济损失的赔偿，而非罚款。

此外，公司在管理员工时可以采取其他合法合规的方式，如纪律处分（如警告、记过等书面形式记录员工过错）、将工作表现与绩效奖金挂钩（但需提前约定考核标准）、对严重违纪或失职的员工依法解除劳动关系等。

总的来说，公司在对员工进行管理时，应遵守相关法律法规，确保管理行为的合法性和合规性。如果员工遭遇了不合理的罚款或其他违法行为，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。