聘用合同和协议书的主要区别体现在适用主体、内容、法律依据、双方主体地位、社会保障以及争议解决方式等多个方面。以下是对这两者的详细比较：

1. 适用主体与范围：

   • 聘用合同主要适用于事业单位与其工作人员之间，是劳动合同制在事业单位的特殊运用形式。
   • 协议书（此处特指劳务协议或聘用协议）则适用范围更广，可适用于事业单位、社会团体、企业及个人之间，特别侧重于高层管理人员、技术人员等特定岗位。

2. 合同内容与灵活性：

   • 聘用合同必须包含劳动合同的法定必备条款，如合同期限、工作内容、工作时间、劳动报酬、社会保险等。
   • 协议书内容相对灵活，由双方协商确定，可能更侧重于工作内容、报酬、期限等，对福利待遇、社保等约定可能较少。

3. 法律依据：

   • 聘用合同受《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等劳动法律法规调整。
   • 协议书则主要遵循《中华人民共和国民法典》等民事法律法规，强调意思自治原则。

4. 双方主体地位：

   • 聘用合同中，虽订立时双方地位平等，但履行过程中劳动者需服从用人单位管理，存在隶属关系。
   • 协议书中双方主体地位平等，为平等的民事合同关系。

5. 社会保障：

   • 聘用合同中用人单位必须为劳动者缴纳社会保险，包括养老、医疗、失业、工伤和生育五大险种。
   • 协议书中社保缴纳由双方约定，提供劳务者通常无法享受用人单位的社保待遇。

6. 争议解决方式：

   • 聘用合同争议需先向劳动争议调解委员会申请调解，调解不成再向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的可向法院提起诉讼。劳动仲裁是前置程序。
   • 协议书争议则通过协商、调解、仲裁或民事诉讼等方式解决，主要依据协议和民事法律法规。

综上所述，聘用合同和协议书在多个方面存在显著差异。选择使用哪种形式，需根据双方的实际情况和具体需求来确定。如有进一步疑问或需要详细法律咨询，请直接向我提问。