违法建设拆除的施工单位由行政机关指定，拆除费用由违法行为人承担。以下是对此结论的详细分析：

一. 施工单位的规定

• 根据相关法律法规，对违法的建筑物、构筑物、设施等需要强制拆除的，应当由行政机关予以公告，并限期当事人自行拆除。若当事人在法定期限内不申请行政复议或提起行政诉讼，又不拆除的，行政机关可以依法强制拆除。在此过程中，施工单位通常由行政机关指定或按照相关程序确定。

二. 费用的管理规定

• 根据《汕头经济特区城乡规划条例》第一百零四条，若建设单位或个人在城乡规划主管部门作出责令限期拆除并清理现场的决定后，逾期不拆除并清理现场的，由本级人民政府责成的部门依法强制拆除并清理现场。强制拆除和清理现场的费用由违法行为人承担。
• 这一规定明确了违法建设拆除费用的承担主体，即违法行为人，也就是违建者。

综上所述，违法建设拆除的施工单位由行政机关指定，而拆除费用则由违法行为人承担。这一规定旨在维护城乡规划秩序，保护公共利益，同时确保违法者承担其违法行为带来的后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。